3-2-1 Pinguïns! vertelt het verhaal over de tweeling Jason en Michelle die een speelgoedruimteschip en vier eigenzinnige pinguïns ontdekken op oma's zolder.
De pinguïns nemen de tweeling mee op avontuur naar het universum, waar ze van alles beleven en leren. Hun eerste stop is de planeet 'Effe-op-je-beurtwachten', waar ze een lesje leren in geduld. Daarna leren ze de hagedissenkoning dat vals spelen niet loont en bezoeken ze het waanzinnige klaagcircus (waar iedereen bedroefd vandaan komt). Om de vuurtoren Kilowatt te repareren en de ruimtetornado tegen te houden, moeten de
kinderen eerst leren samenwerken.
